nanoporetech 使用納米孔測序技術的微生物學

更新時間：2021-02-08

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完整的細菌，真菌和病毒（DNA或RNA）基因組，可進行長時間的納米孔測序。通過快速的病原體檢測方法（無論是在實驗室還是在野外），從環境或單一生物樣品中鑒定并鑒定微生物。如果需要，還應附有抗菌素耐藥性分析。使用直接RNA或cDNA方法對全長轉錄本進行測序，以進行準確的基因表達和轉錄本亞型分析。

通過長讀和超長讀來簡化從頭組裝并校正參考基因組
解決結構變化和重復區域
測序和定量全長轉錄本，以進行明確的基因表達和亞型分析
通過直接測序消除偏倚并鑒定表觀遺傳修飾
實時獲取結果，包括物種識別
使用Flongle，MinION，GridION或PromethION擴展到您的需求

全面分析微生物基因組（DNA或RNA）。準確定位重復區域和結構變異，并使用長測序讀數將質粒與基因組區分開。簡化從頭組裝并更正現有的參考基因組。可擴展以適應您從工作臺到現場的需求。

準確解析具有挑戰性的基因組區域（結構變異和重復）
簡化從頭組裝和正確的參考基因組，長讀
使用全基因組，靶向和多路復用方法
無需PCR的直接DNA和RNA測序消除了偏倚
通過實時數據流獲得即時結果
可擴展以滿足您的需求-1.8 Gb Flongle；30 Gb MinION；150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48

實時準確識別微生物和相關的抗藥性（AMR）。Oxford Nanopore提供了完整的解決方案-從快速的10分鐘文庫制備（DNA）到使用EPI2ME平臺的實時系統發育和AMR分析。使用宏基因組或靶向16S rRNA方法。使用便攜式MinION或臺式GridION或PromethION設備在樣品源處或實驗室中進行測序。

實時識別微生物和AMR，并通過長時間閱讀來區分密切相關的菌株
快速的全基因組或靶向（例如16S）方法簡化了工作流程
使用便攜式MinION和Flongle在樣品源處進行測序
多重樣品獲得更具成本效益的結果
可擴展以滿足您的需求-1.8 Gb Flongle；30 Gb MinION；150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48

使用全長納米孔測序讀數，解析轉錄本亞型并測量真實的基因表達譜。低投入量與快速，簡化的工作流程相結合，可進行高度敏感的基因表達分析

測序完整的全長轉錄本，以明確鑒定轉錄本亞型
準確定量同工型以進行敏感的基因表達分析
使用直接cDNA或直接RNA測序消除PCR偏倚
輕松識別反義轉錄本和lncRNA亞型
新增功能：使用更新的RNA和cDNA測序試劑盒，只需較少的投入即可獲得更高的產量

微生物表現出許多類型的堿基修飾，可影響一系列功能，包括基因表達和抗菌素耐藥性。與基于替代測序的分析方法不同，納米孔測序不需要擴增或鏈合成，可以減少偏差并保留修飾的堿基信息，這些信息可以與核苷酸序列一起直接檢測到-無需額外的樣品轉換。

在一次測定中鑒定修飾的堿基和核苷酸序列
將基本修改記錄為標準-準備就緒時進行分析
使用無PCR的全基因組，全轉錄組或靶向測序方法
使用核苷酸類似物探索基因組復制
快速的10分鐘文庫制備（DNA）-不需要亞硫酸氫鹽或化學轉化
使用越來越多的工具來分析數據

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